GB/SA法

GB/SA法 (GB/SA method)

GB/SA法とは、静電ポテンシャルを一般化Born(GB)式で求め、かつ非極性の寄与を溶媒接触可能表面積(SA)をもとに溶媒和エネルギーを計算するモデルをいいます。

その際、水などの溶媒分子は誘電率を持った連続体として近似します。原子間に働く相互作用のポテンシャルエネルギーとの和を取ることで、タンパク質同士あるいはタンパク質と低分子化合物が脱溶媒和を経て複合体を形成する際の自由エネルギー差をより正確に見積もることができます。