分子力学法 (Molecular mechanics method)分子力学法とは原子間に働く相互作用のポテンシャルエネルギーにもとづいて分子構造を最適化する方法をいいます。 各原子に働くポテンシャルエネルギーを計算するための計算式とパラメータを力場といい、AMBER、CHARMm、OPLS、MMFFなどがよく知られています。このポテンシャルエネルギーに関して最小値とそのときの三次元座標の組み合わせを求め、最安定な構造すなわち最適構造を得ます。 |
分子力学法 (Molecular mechanics method)分子力学法とは原子間に働く相互作用のポテンシャルエネルギーにもとづいて分子構造を最適化する方法をいいます。 各原子に働くポテンシャルエネルギーを計算するための計算式とパラメータを力場といい、AMBER、CHARMm、OPLS、MMFFなどがよく知られています。このポテンシャルエネルギーに関して最小値とそのときの三次元座標の組み合わせを求め、最安定な構造すなわち最適構造を得ます。 |