ポケット (Pocket)ポケットとは、本サイトでは、タンパク質の立体構造表面にあるくぼみをいいます。また、一般にはキャビティ(Cavity)という場合もあります。 タンパク質は、凹凸のある立体構造をとっています。その結果、立体構造の表面にはくぼみが生まれ、これらをポケットと呼んでいます。 ポケットの中には、リガンドが結合する部位もあり、そのような場所は、タンパク質の機能にかかわっています。このような部位は鍵穴にたとえられます。その時の鍵は、リガンドということになります。タンパク質の立体構造情報から、ポケットを、コンピュータを使って探索し、創薬に適するかどうかを評価することができます。創薬において、SBDDを行なう場合にはとても重要な場所であり、このようなポケットに対してうまく適合する化合物を探索して行きます。 |
