タンパク質disorder領域予測プログラム

POODLE-L

ここ掘れワンワン － disorderを掘り当てろ －

POODLE-Lの概要

POODLE (Prediction Of Order and Disorder by machine LEarning) は、高い予測精度を持つタンパク質のdisorder領域*予測のためのプログラムパッケージです。ファルマデザインと独立行政法人産 業技術総合研究所 生命情報工学研究センター (CBRC) と共同開発されました。

ファルマデザインでは、POODLEプログラムパッケージの中の最も実用に適するPOODLE-Lについて、インハウスでもご利用可能なバージョンを販売しております。

*disorder領域:  フリーな状態である特定の立体構造をとらない領域

ご参考資料

学会・展示会発表 (ポスター)

  • Hirose S, Yokota K, Kuroda Y, Wako H, Kanai S, Noguchi T (2007) Analysis of internal and external motion in protein structure. 日本バイオインフォマティクス学会2007年年会 [ポスター （PDF資料)]
  • 廣瀬修一, 横田恭宣, 黒田裕, 輪湖博, 金井理, 野口保 (2007) 配列情報からのタンパク質揺らぎ領域の予測. CBRC2007 [ポスター (PDF資料)]
  • Hirose S, Yokota K, Kuroda Y, Wako H, Kanai S, Noguchi T (2007) Prediction of protein structural flexibility from an amino acid sequence. 第45回生物物理学会年会 [ポスター (PDF資料)]
  • 廣瀬修一, 黒田裕, 金井理, 野口保 (2007) タンパク質の機能ドメインに対するdisorder領域の解析. 第7回日本蛋白質科学会年会[ポスター (PDF資料)]
 
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