QM/MM法 (Quantum Mechanics / Molecular Mechanics method)QM/MM法とは、量子力学計算(Quantum Mechanics)と分子力学計算(Molecular Mechanics)を組み合わせてそれぞれの長所(精度と速さ)を取り入れた方法をいいます。 量子力学計算とは分子軌道法による計算をいいます。一方、分子力場計算は、古典力学にもとづいて分子の静的な構造をシミュレートするための手法です。QM/MM法は、タンパク質などの巨大分子の構造をコンピュータでシミュレートする(どのような立体構造を取っているかを調べる)ことに用いられます。タンパク質のような巨大分子を取り扱う場合、量子力学計算は精度の高い結果を与えますが非常に計算時間がかかります。 一方、分子力学計算は量子力学計算よりも精度は落ちるものの量子力学計算に比べて計算時間がかかりません。QM/MM法はこれらの長所を取り入れた手法です。すなわち、QM/MM法では、巨大分子について構造をシミュレートする場合、詳細に知りたい部分については量子化学計算を用い、その他の部分については分子力学計算を利用するというやり方で対応します。 |
