ホモロジーモデリング (Homology modeling)ホモロジーモデリングとは、コンピュータ上で行なうタンパク質の立体構造を予測する手法の一つです。 立体構造が未知のタンパク質の構造を構築する場合、まずそれに相同で立体構造が決定されているタンパク質を探索し、次にその立体構造を鋳型 (テンプレート) として構造が未知のタンパク質の構造を構築し、さらに分子動力学法などにより構造を最適化します。 ホモロジーモデリングは、相同なタンパク質(共通祖先を持つタンパク質)はお互いに類似した立体構造を持つという経験則基づいて、考案された方法です。 |
